Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
J3QRK9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QRK9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QRK9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QRK9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QRK9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QRK9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms