Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C0C1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H7C0C1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C0C1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C0C1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H7C0C1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H7C0C1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H7C0C1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms