Protein–RNA interactions for Protein: H3BVH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BVH4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BVH4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BVH4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BVH4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BVH4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3BVH4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3BVH4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3BVH4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3BVH4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H3BVH4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms