Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C6orf229H3BNL8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf229H3BNL8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms