Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERVV-1B6SEH8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms