Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4E171 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4E171 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4E171 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4E171 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4E171 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4E171 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4E171 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
B4E171 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
B4E171 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
B4E171 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms