Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO5BA8MYB1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO5BA8MYB1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms