Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC169A6NNP5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms