Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBA6A0AVT1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBA6A0AVT1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms