Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGHV3-16A0A0C4DH30 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-16A0A0C4DH30 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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IGHV3-16A0A0C4DH30 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-16A0A0C4DH30 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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IGHV3-16A0A0C4DH30 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-16A0A0C4DH30 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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IGHV3-16A0A0C4DH30 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-16A0A0C4DH30 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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IGHV3-16A0A0C4DH30 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-16A0A0C4DH30 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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