Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 AP001206.1-201ENST00000635554 720 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CEP57L1-205ENST00000517392 2771 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 SPDYE16-202ENST00000632547 3434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RGMA-201ENST00000329082 11350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ERVV-2-201ENST00000601417 2431 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AL117258.1-201ENST00000637218 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 TRPS1-211ENST00000520276 4083 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CYTIP-201ENST00000264192 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 MYHAS-201ENST00000587182 2274 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AKR1C3-201ENST00000380554 1807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CRISP2-202ENST00000616725 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 HMGCLL1-205ENST00000398661 2532 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 PDZK1-201ENST00000344770 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 PKMP2-201ENST00000412159 1677 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 NECAP1-219ENST00000639811 2175 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 YEATS2-AS1-201ENST00000425008 2442 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ZNF585A-203ENST00000392157 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 HERC2P2-201ENST00000613386 5181 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 LCLAT1-202ENST00000319406 2774 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ZNF221-201ENST00000251269 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 SH3TC2-215ENST00000515425 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 LINC00525-201ENST00000412730 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 FAM96AP2-201ENST00000414727 477 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC012363.2-201ENST00000437837 555 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AL591806.1-201ENST00000447167 1109 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AL031674.1-203ENST00000448013 538 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 UGT1A11P-201ENST00000456635 849 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RN7SL151P-201ENST00000460537 283 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC093627.5-201ENST00000462565 662 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 NMNAT3-214ENST00000514703 584 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RN7SKP52-201ENST00000516219 250 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RNU1-125P-201ENST00000516752 129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC025524.2-201ENST00000520862 536 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC073612.1-201ENST00000548802 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AL160314.2-201ENST00000554857 662 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC010542.2-201ENST00000568560 511 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 MIR4269-201ENST00000578705 84 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ZNF85-208ENST00000597314 563 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 C1orf186-209ENST00000603488 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 BCAS3-233ENST00000626960 227 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC084879.1-201ENST00000636165 1201 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 MFSD8-259ENST00000642042 2303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 WDR36-204ENST00000513710 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 GSDMC-204ENST00000619643 1831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 TSHZ1-201ENST00000322038 4992 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC112206.2-203ENST00000513234 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 IL24-204ENST00000391929 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 PRKG1-204ENST00000373985 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RCAN1-204ENST00000399272 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 SMARCC2-209ENST00000550164 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 LINC02287-201ENST00000555299 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 MROH5-205ENST00000621837 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RFLNB-201ENST00000329099 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 NPHP1-207ENST00000445609 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CES5A-206ENST00000521992 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CARMIL1-201ENST00000329474 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 FLJ40194-201ENST00000322227 2317 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 DICER1-AS1-203ENST00000439999 2323 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC068282.1-201ENST00000433673 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 CAMSAP2-203ENST00000413307 4498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 FCGR2A-201ENST00000271450 2412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AP3B2-215ENST00000620652 3729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 S100A4-203ENST00000368715 573 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 IGLV3-25-201ENST00000390305 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RN7SKP3-201ENST00000411409 358 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 RPS5P2-201ENST00000415238 640 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AC006195.1-201ENST00000423599 923 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 AL139246.1-201ENST00000424657 455 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SCNN1GP51170 OR4D8P-201ENST00000431137 930 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms