Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCOA3Q9Y6Q9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms