Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX9Q9Y5X1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms