Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms