Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms