Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HHLA3Q9XRX5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HHLA3Q9XRX5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms