Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms