Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN2Q9UNF0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACSIN2Q9UNF0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms