Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AMFRQ9UKV5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms