Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms