Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLXNA1Q9UIW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms