Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms