Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX20Q9UHI6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms