Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPC1L1Q9UHC9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPC1L1Q9UHC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms