Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms