Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1V8

SAMD15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD15Q9P1V8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD15Q9P1V8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD15Q9P1V8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms