Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms