Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CABP1Q9NZU7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms