Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMOD4Q9NZQ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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