Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms