Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms