Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTMR4Q9NYA4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms