Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA2D2Q9NY47 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA2D2Q9NY47 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms