Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB4Q9NTQ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms