Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC4Q9NTJ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC4Q9NTJ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms