Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms