Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH2B1Q9NRF2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2B1Q9NRF2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms