Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms