Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPF2Q9HAU5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPF2Q9HAU5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms