Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC52A2Q9HAB3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC52A2Q9HAB3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms