Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIOBPQ9H2D6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms