Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms