Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMG9Q9H0W8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms