Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP44Q9H0E7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms