Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF3Q9H094 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms