Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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C20orf27Q9GZN8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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C20orf27Q9GZN8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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C20orf27Q9GZN8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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C20orf27Q9GZN8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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C20orf27Q9GZN8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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C20orf27Q9GZN8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C20orf27Q9GZN8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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