Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
WDR12Q9GZL7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR12Q9GZL7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms