Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VN1R3Q9BXE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms