Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM14BQ9BX40 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms