Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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